Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA3P25788 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms