Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR1P18146 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms