Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD4O60885 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD4O60885 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD4O60885 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD4O60885 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD4O60885 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD4O60885 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms