Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms