Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP3Q9UKI2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms