Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CC2D2AQ9P2K1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CC2D2AQ9P2K1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms