Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJC4Q9NNZ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms