Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms