Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC77Q9BR77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms