Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms