Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD4Q96DM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms