Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4DQ8WXI8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4DQ8WXI8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms