Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms