Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms