Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE3Q6ZMZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms