Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1EQ15878 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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