Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms