Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 PACS2-212ENST00000551743 1876 ntTSL 516.59■□□□□ 0.258e-12■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 PACS2-206ENST00000547903 1157 ntTSL 516.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 214.2□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.096e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.38□□□□□ -0.276e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.876e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.46□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.45□□□□□ -1.76e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.54□□□□□ -1.846e-11■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 315.74■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 HNRNPL-207ENST00000598985 900 ntTSL 512.93□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 APLP2-222ENST00000533860 1424 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 510.15□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 CNOT3-205ENST00000457463 1269 ntTSL 310.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 36.6
SF3B4Q15427 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.115e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 VPS29-205ENST00000548539 598 ntTSL 33.98□□□□□ -1.773e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.947e-10■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 CRTC2-209ENST00000493909 207 ntTSL 20.64□□□□□ -2.314e-19■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RPA1-205ENST00000573924 574 ntTSL 46.76□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-203ENST00000407117 789 ntTSL 325.38■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.124e-9■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-208ENST00000458278 623 ntTSL 315.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ANKRD54-209ENST00000464849 456 ntTSL 311.4□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 GOT1-203ENST00000489349 646 ntTSL 25.11□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 322.1■■□□□ 1.132e-12■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-12■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 220.4■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 TMEM214-206ENST00000435172 1480 ntTSL 513.92□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.663e-9■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 A2M-206ENST00000495442 729 ntTSL 37.66□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 A2M-207ENST00000495709 509 ntTSL 23.55□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 516.92■□□□□ 0.38e-24■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 MBD1-221ENST00000589867 673 ntTSL 315.57■□□□□ 0.088e-24■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 IL17RC-218ENST00000465794 472 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RBBP5-203ENST00000484379 367 ntTSL 214.35□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 IL17RC-220ENST00000466712 458 ntTSL 38.65□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HNRNPA1-207ENST00000547870 920 ntTSL 35.6□□□□□ -1.516e-10■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HNRNPA1-213ENST00000551702 481 ntTSL 33.21□□□□□ -1.96e-10■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 310.05□□□□□ -0.89e-9■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.127e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-214ENST00000529641 881 ntTSL 57.32□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 27.21□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 HBS1L-209ENST00000526100 1600 ntTSL 24.56□□□□□ -1.687e-7■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.252e-25■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-25■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 WASH3P-202ENST00000557932 1679 ntTSL 512.4□□□□□ -0.422e-25■■■■■ 36.5
SF3B4Q15427 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 424.1■■□□□ 1.452e-19■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-19■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-19■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-19■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 RNF126-202ENST00000586749 2092 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-209ENST00000483652 1994 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.577e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.537e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-205ENST00000444954 598 ntTSL 318.14■□□□□ 0.497e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.277e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.237e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.187e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CRELD2-210ENST00000487969 2622 ntTSL 214.78□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt13.72□□□□□ -0.211e-20■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SULT1A2-205ENST00000534108 1540 ntTSL 212.27□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 411.82□□□□□ -0.527e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.557e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SULT1A2-203ENST00000526384 773 ntTSL 310.91□□□□□ -0.667e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SULT1A2-201ENST00000335715 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-11■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SLC43A1-209ENST00000533515 774 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 SLC43A1-205ENST00000529452 821 ntTSL 311.49□□□□□ -0.575e-9■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 AP1G2-218ENST00000555510 584 ntTSL 511.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 36.4
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