Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUM3Q15397 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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