Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PDK1Q15118 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PDK1Q15118 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PDK1Q15118 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PDK1Q15118 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PDK1Q15118 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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