Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC1AQ14683 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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