Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHROOM2Q13796 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
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SHROOM2Q13796 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SHROOM2Q13796 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SHROOM2Q13796 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
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