Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLAMF1Q13291 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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