Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms