Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF3P15923 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCF3P15923 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCF3P15923 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF3P15923 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF3P15923 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF3P15923 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF3P15923 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF3P15923 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms