Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF1RP07333 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms