Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB3O94955 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms