Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIBO00712 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIBO00712 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIBO00712 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIBO00712 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIBO00712 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms