Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms