Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYH0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYH0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYH0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYH0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYH0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms