Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms