Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM5BQ9UGL1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms