Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM10Q9UDY6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM10Q9UDY6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms