Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms