Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC106Q9BWC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC106Q9BWC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC106Q9BWC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC106Q9BWC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC106Q9BWC9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms