Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT12Q99456 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms