Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF3Q5VWG9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms