Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM3Q53FZ2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms