Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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