Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP13Q15645 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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