Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR6A1Q15406 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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NR6A1Q15406 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NR6A1Q15406 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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