Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP1A4Q13733 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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