Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 UTP15YMR093W 1542 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 SCY1YGL083W 2415 nt2.61□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 TRZ1YKR079C 2517 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 MST27YGL051W 705 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 RTS3YGR161C 792 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 CAP1YKL007W 807 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 SDC25YLL016W 3147 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 NPR1YNL183C 2373 nt2.6□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 TOP2YNL088W 4287 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 DAD1YDR016C 285 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 GPI19YDR437W 423 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 OTU2YHL013C 924 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.59□□□□□ -1.99
SPE3Q12074 SCP160YJL080C 3669 nt2.59□□□□□ -2
SPE3Q12074 SMY2YBR172C 2223 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 KEL2YGR238C 2649 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 TPS2YDR074W 2691 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 KAR9YPL269W 1935 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 YDR203WYDR203W 318 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 ADK1YDR226W 669 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 PRE4YFR050C 801 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 PGD1YGL025C 1194 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 YMR187CYMR187C 1296 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 AMS1YGL156W 3252 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 NEL1YHR035W 1893 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 ISW1YBR245C 3390 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 UBP16YPL072W 1500 nt2.58□□□□□ -2
SPE3Q12074 YCT1YLL055W 1596 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 DAL5YJR152W 1632 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 YDR248CYDR248C 582 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 RPS26BYER131W 360 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 RGM1YMR182C 636 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 PEP12YOR036W 867 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 ATP20YPR020W 348 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 VID24YBR105C 1089 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 SWA2YDR320C 2007 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 UBX3YDL091C 1368 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 CTF13YMR094W 1437 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 INO80YGL150C 4470 nt2.57□□□□□ -2
SPE3Q12074 PBP4YDL053C 558 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 YEA4YEL004W 1029 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 YJL086CYJL086C 369 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 RPS29AYLR388W 171 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 URA5YML106W 681 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 YCL002CYCL002C 792 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 EDS1YBR033W 2760 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 PUT3YKL015W 2940 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 MMS1YPR164W 4224 nt2.56□□□□□ -2
SPE3Q12074 SSY1YDR160W 2559 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 GPI17YDR434W 1605 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YIL082WYIL082W 873 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YIL166CYIL166C 1629 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 SGM1YJR134C 2124 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 RNP1YLL046C 750 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 UBC12YLR306W 567 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 FAR11YNL127W 2862 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YRR1YOR162C 2433 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YCL020WYCL020W 1317 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 PDR11YIL013C 4236 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 PSD2YGR170W 3417 nt2.55□□□□□ -2
SPE3Q12074 YKL075CYKL075C 1353 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 RPS17BYDR447C 411 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YIP1YGR172C 747 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 AYR1YIL124W 894 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YJL202CYJL202C 348 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 VPH2YKL119C 648 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 RPL36AYMR194W 303 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 MED8YBR193C 672 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YKU80YMR106C 1890 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 APL5YPL195W 2799 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 YKR078WYKR078W 1758 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 ARP8YOR141C 2646 nt2.54□□□□□ -2
SPE3Q12074 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 MRD1YPR112C 2664 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 VTC1YER072W 390 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 GLC7YER133W 939 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 YGR050CYGR050C 357 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 PRP38YGR075C 729 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 CKA1YIL035C 1119 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 SDS22YKL193C 1017 nt2.53□□□□□ -2
SPE3Q12074 YCR099CYCR099C 468 nt2.52□□□□□ -2.01
SPE3Q12074 MPO1YGL010W 525 nt2.52□□□□□ -2.01
SPE3Q12074 FYV4YHR059W 393 nt2.52□□□□□ -2.01
SPE3Q12074 HRD3YLR207W 2502 nt2.51□□□□□ -2.01
SPE3Q12074 PHO91YNR013C 2685 nt2.51□□□□□ -2.01
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