RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
TRZ1	YKR079C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TRZ1	YKR079C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TRZ1	YKR079C	TFA1	P36100	482 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TRZ1	YKR079C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TRZ1	YKR079C	AVT3	P36062	692 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TRZ1	YKR079C	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TRZ1	YKR079C	ISW2	Q08773	1120 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TRZ1	YKR079C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
TRZ1	YKR079C	PRI1	P10363	409 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TRZ1	YKR079C	FAP1	P53971	965 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TRZ1	YKR079C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
TRZ1	YKR079C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
TRZ1	YKR079C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
TRZ1	YKR079C	AAD16	Q02895	342 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TRZ1	YKR079C	REB1	P21538	810 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TRZ1	YKR079C	SPT21	P35209	758 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TRZ1	YKR079C	RIM101	P33400	625 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRZ1	YKR079C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TRZ1	YKR079C	PTP3	P40048	928 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRZ1	YKR079C	PRY3	P47033	881 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRZ1	YKR079C	SSP1	P38871	571 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRZ1	YKR079C	DMA1	P38823	416 aa		5.55	□□□□□ -1.52
TRZ1	YKR079C	OXP1	P28273	1286 aa		5.54	□□□□□ -1.52
TRZ1	YKR079C	MRPL32	P25348	183 aa		5.51	□□□□□ -1.53
TRZ1	YKR079C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
TRZ1	YKR079C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	not detected
TRZ1	YKR079C	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRZ1	YKR079C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRZ1	YKR079C	YLR271W	Q06152	274 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRZ1	YKR079C	TFC8	Q12308	588 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRZ1	YKR079C	RSM7	P47150	247 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRZ1	YKR079C	HO	P09932	586 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRZ1	YKR079C	MGA2	P40578	1113 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRZ1	YKR079C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
TRZ1	YKR079C	CDC27	P38042	758 aa		5.34	□□□□□ -1.56
TRZ1	YKR079C	DCD1	P06773	312 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TRZ1	YKR079C	AI2	P03876	854 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRZ1	YKR079C	YCK3	P39962	524 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRZ1	YKR079C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRZ1	YKR079C	BBC1	P47068	1157 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRZ1	YKR079C	CST9	Q06032	482 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRZ1	YKR079C	BCH2	P36122	765 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRZ1	YKR079C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRZ1	YKR079C	EPS1	P40557	701 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRZ1	YKR079C	LEO1	P38439	464 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRZ1	YKR079C	TAF7	Q05021	590 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TRZ1	YKR079C	LEU3	P08638	886 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TRZ1	YKR079C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
TRZ1	YKR079C	BDF1	P35817	686 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	SCY1	P53009	804 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	MRM1	P25270	412 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	RAM2	P29703	316 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	RTG3	P38165	486 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRZ1	YKR079C	YGL015C	P33199	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	IFH1	P39520	1085 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	RCR1	P38212	213 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	YPR148C	Q06523	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	CKB1	P43639	278 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRZ1	YKR079C	VPS70	P47161	811 aa		5	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	VPS29	P38759	282 aa		5	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
TRZ1	YKR079C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	COQ8	P27697	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRZ1	YKR079C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
TRZ1	YKR079C	STS1	P38637	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	MIF2	P35201	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	DSF2	P38213	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRZ1	YKR079C	PBS2	P08018	668 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	EDS1	P38073	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	YFR006W	P43590	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	YAP5	P40574	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	TGL3	P40308	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	MAM3	Q12296	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRZ1	YKR079C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	IES2	P40154	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	PIB1	Q06651	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	DMA2	P53924	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	AIM7	Q12156	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	ATH1	P48016	1211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	KIN1	P13185	1064 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	COX6	P00427	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	GUT1	P32190	709 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	GLC3	P32775	704 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	SAM3	Q08986	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRZ1	YKR079C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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