RNA–Protein interactions for RNA: YHL006W-A

YHL006W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHL006W-A, Length 354 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL006W-AYHL006W-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YHL006W-AYHL006W-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YHL006W-AYHL006W-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
YHL006W-AYHL006W-A TFA1P36100 482 aa6.52□□□□□ -1.37
YHL006W-AYHL006W-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
YHL006W-AYHL006W-A AVT3P36062 692 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL006W-AYHL006W-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YHL006W-AYHL006W-A ISW2Q08773 1120 aa6□□□□□ -1.45
YHL006W-AYHL006W-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YHL006W-AYHL006W-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
YHL006W-AYHL006W-A FAP1P53971 965 aa5.9□□□□□ -1.46
YHL006W-AYHL006W-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
YHL006W-AYHL006W-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
YHL006W-AYHL006W-A REB1P21538 810 aa5.77□□□□□ -1.49
YHL006W-AYHL006W-A PRI1P10363 409 aa5.76□□□□□ -1.49
YHL006W-AYHL006W-A AAD16Q02895 342 aa5.66□□□□□ -1.5
YHL006W-AYHL006W-A PTP3P40048 928 aa5.65□□□□□ -1.5
YHL006W-AYHL006W-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YHL006W-AYHL006W-A DMA1P38823 416 aa5.55□□□□□ -1.52
YHL006W-AYHL006W-A SPT21P35209 758 aa5.54□□□□□ -1.52
YHL006W-AYHL006W-A RIM101P33400 625 aa5.53□□□□□ -1.52
YHL006W-AYHL006W-A PRY3P47033 881 aa5.47□□□□□ -1.53
YHL006W-AYHL006W-A SSP1P38871 571 aa5.45□□□□□ -1.54
YHL006W-AYHL006W-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YHL006W-AYHL006W-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YHL006W-AYHL006W-A OXP1P28273 1286 aa5.38□□□□□ -1.55
YHL006W-AYHL006W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.38□□□□□ -1.55not detected
YHL006W-AYHL006W-A MRPL32P25348 183 aa5.34□□□□□ -1.55
YHL006W-AYHL006W-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YHL006W-AYHL006W-A HOP09932 586 aa5.29□□□□□ -1.56
YHL006W-AYHL006W-A YLR271WQ06152 274 aa5.29□□□□□ -1.56
YHL006W-AYHL006W-A DCD1P06773 312 aa5.25□□□□□ -1.57
YHL006W-AYHL006W-A RSM7P47150 247 aa5.25□□□□□ -1.57
YHL006W-AYHL006W-A MGA2P40578 1113 aa5.22□□□□□ -1.57
YHL006W-AYHL006W-A TFC8Q12308 588 aa5.22□□□□□ -1.57
YHL006W-AYHL006W-A CDC27P38042 758 aa5.16□□□□□ -1.58
YHL006W-AYHL006W-A CST9Q06032 482 aa5.16□□□□□ -1.58
YHL006W-AYHL006W-A AI2P03876 854 aa5.15□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A BBC1P47068 1157 aa5.14□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A TAF7Q05021 590 aa5.12□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A LEO1P38439 464 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A BCH2P36122 765 aa5.09□□□□□ -1.59
YHL006W-AYHL006W-A EPS1P40557 701 aa5.04□□□□□ -1.6
YHL006W-AYHL006W-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
YHL006W-AYHL006W-A MRM1P25270 412 aa5.03□□□□□ -1.6
YHL006W-AYHL006W-A YCK3P39962 524 aa5.03□□□□□ -1.6
YHL006W-AYHL006W-A LEU3P08638 886 aa5□□□□□ -1.61
YHL006W-AYHL006W-A SCY1P53009 804 aa5□□□□□ -1.61
YHL006W-AYHL006W-A BDF1P35817 686 aa4.99□□□□□ -1.61
YHL006W-AYHL006W-A RAM2P29703 316 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL006W-AYHL006W-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YHL006W-AYHL006W-A SPB4P25808 606 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
YHL006W-AYHL006W-A RCR1P38212 213 aa4.96□□□□□ -1.62
YHL006W-AYHL006W-A RTG3P38165 486 aa4.95□□□□□ -1.62
YHL006W-AYHL006W-A VPS70P47161 811 aa4.94□□□□□ -1.62
YHL006W-AYHL006W-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YHL006W-AYHL006W-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A IFH1P39520 1085 aa4.89□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A RPN1P38764 993 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A CKB1P43639 278 aa4.88□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A YGL015CP33199 130 aa4.86□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A MIF2P35201 549 aa4.85□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A YPR148CQ06523 435 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL006W-AYHL006W-A COQ8P27697 501 aa4.83□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A VPS29P38759 282 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A YFR006WP43590 535 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A PBS2P08018 668 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
YHL006W-AYHL006W-A DMA2P53924 522 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YHL006W-AYHL006W-A STS1P38637 319 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A PIB1Q06651 286 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A YOR238WQ08634 303 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A DSF2P38213 736 aa4.76□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A MAM3Q12296 706 aa4.75□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A EDS1P38073 919 aa4.74□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A IES2P40154 320 aa4.73□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A GLC3P32775 704 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL006W-AYHL006W-A KIN1P13185 1064 aa4.71□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A YAP5P40574 245 aa4.7□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A ATH1P48016 1211 aa4.68□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A ATF2P53296 535 aa4.68□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A DIT2P21595 489 aa4.67□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A VHR2P40041 505 aa4.67□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YHL006W-AYHL006W-A KIC1P38692 1080 aa4.65□□□□□ -1.67
YHL006W-AYHL006W-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YHL006W-AYHL006W-A COX6P00427 148 aa4.64□□□□□ -1.67
YHL006W-AYHL006W-A GTT3P39996 337 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.2 ms