Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABPB1Q06547 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABPB1Q06547 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms