Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1-1P60608 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms