Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A2P55011 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms