Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNT3P45378 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms