Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX2P40425 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX2P40425 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX2P40425 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX2P40425 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX2P40425 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX2P40425 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms